Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CACNA1CQ13936 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CACNA1CQ13936 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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