Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CUL4BQ13620 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CUL4BQ13620 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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