Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
MTMR3Q13615 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MTMR3Q13615 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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