Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BFSP2Q13515 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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