Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PMS2P3Q13401 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
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