Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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