Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCGB2A2Q13296 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SCGB2A2Q13296 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms