Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ERCC8Q13216 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ERCC8Q13216 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ERCC8Q13216 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ERCC8Q13216 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ERCC8Q13216 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ERCC8Q13216 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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ERCC8Q13216 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ERCC8Q13216 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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