Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MRPL28Q13084 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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