Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GRIK2Q13002 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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