Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
BNIP3Q12983 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BNIP3Q12983 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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