Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PTP4A2Q12974 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTP4A2Q12974 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms