Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNTN1Q12860 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNTN1Q12860 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
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