Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNG1Q06432 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms