Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GRIN1Q05586 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GRIN1Q05586 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms