Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms