Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BNC1Q01954 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BNC1Q01954 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms