Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPIBQ01892 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIBQ01892 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms