Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A2Q01362 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A2Q01362 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms