Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MYBPC1Q00872 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms