Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK6Q00534 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms