Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EFNB1P98172 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EFNB1P98172 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms