Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VLDLRP98155 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms