Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PITX1P78337 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX1P78337 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX1P78337 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX1P78337 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX1P78337 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX1P78337 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PITX1P78337 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PITX1P78337 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX1P78337 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX1P78337 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX1P78337 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX1P78337 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX1P78337 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX1P78337 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX1P78337 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX1P78337 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX1P78337 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX1P78337 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PITX1P78337 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms