Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
HBBP68871 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
HBBP68871 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
HBBP68871 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
HBBP68871 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms