Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms