Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms