Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK2BP67870 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms