Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HERVK_113P63132 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HERVK_113P63132 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms