Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RPS25P62851 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPS25P62851 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPS25P62851 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS25P62851 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS25P62851 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS25P62851 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS25P62851 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS25P62851 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS25P62851 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS25P62851 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS25P62851 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS25P62851 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS25P62851 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS25P62851 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPS25P62851 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPS25P62851 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS25P62851 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPS25P62851 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms