Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTA2P62736 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms