Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVS71-1P61550 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ERVS71-1P61550 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms