Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FBXW4P57775 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FBXW4P57775 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms