Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP107P57740 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NUP107P57740 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms