Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NME5P56597 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NME5P56597 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME5P56597 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME5P56597 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME5P56597 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME5P56597 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME5P56597 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME5P56597 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME5P56597 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME5P56597 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NME5P56597 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms