Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRP1P56182 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1P56182 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1P56182 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1P56182 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1P56182 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1P56182 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1P56182 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1P56182 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1P56182 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1P56182 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1P56182 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1P56182 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1P56182 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRP1P56182 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRP1P56182 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RRP1P56182 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RRP1P56182 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RRP1P56182 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RRP1P56182 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms