Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CASP7P55210 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CASP7P55210 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP7P55210 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP7P55210 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP7P55210 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP7P55210 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP7P55210 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP7P55210 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP7P55210 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP7P55210 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP7P55210 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP7P55210 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP7P55210 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP7P55210 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CASP7P55210 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CASP7P55210 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP7P55210 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CASP7P55210 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CASP7P55210 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CASP7P55210 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CASP7P55210 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms