Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EMP3P54852 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EMP3P54852 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EMP3P54852 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EMP3P54852 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EMP3P54852 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EMP3P54852 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EMP3P54852 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EMP3P54852 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EMP3P54852 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EMP3P54852 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EMP3P54852 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
EMP3P54852 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
EMP3P54852 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EMP3P54852 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms