Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GTF2A1P52655 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms