Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK4P51957 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK4P51957 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK4P51957 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK4P51957 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK4P51957 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK4P51957 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK4P51957 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK4P51957 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK4P51957 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK4P51957 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEK4P51957 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK4P51957 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK4P51957 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK4P51957 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK4P51957 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK4P51957 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms