Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPC3P51654 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPC3P51654 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
GPC3P51654 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPC3P51654 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
GPC3P51654 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GPC3P51654 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPC3P51654 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GPC3P51654 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GPC3P51654 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GPC3P51654 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPC3P51654 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPC3P51654 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPC3P51654 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms