Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GSK3BP49841 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms