Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN2P49810 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN2P49810 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSEN2P49810 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSEN2P49810 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN2P49810 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN2P49810 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSEN2P49810 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN2P49810 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN2P49810 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN2P49810 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN2P49810 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN2P49810 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSEN2P49810 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSEN2P49810 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSEN2P49810 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSEN2P49810 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSEN2P49810 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms