Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMPHP49418 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMPHP49418 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMPHP49418 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMPHP49418 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMPHP49418 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMPHP49418 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMPHP49418 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMPHP49418 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMPHP49418 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMPHP49418 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
AMPHP49418 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
AMPHP49418 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPHP49418 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPHP49418 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPHP49418 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPHP49418 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPHP49418 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPHP49418 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPHP49418 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPHP49418 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPHP49418 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPHP49418 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPHP49418 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPHP49418 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
AMPHP49418 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
AMPHP49418 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
AMPHP49418 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AMPHP49418 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms