Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
KDM5CP41229 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KDM5CP41229 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms