Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNCAP37840 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNCAP37840 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNCAP37840 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms