Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms