Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRIM23P36406 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms