Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ACTN2P35609 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ACTN2P35609 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms