Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SCN4AP35499 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCN4AP35499 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms